独立通风笼盒是IVC设备的关键所在，它要具有一定的密闭性，能防止盒外空气的进入，以减少可能的感染来源，又要能让洁净空气流畅进入，并在盒内形成良好的气流动或扩散，与盒内气体混合并把笼盒内的废气排出。

笼盒一般有两种基本形式，而且大多申请了专利保护。一种为笼盒的通排气是阀门开闭式，即上架时打开，取下时自动关闭。阀门有照相机快门式和单片弹簧开关式等。

另一种为盒内终端过滤保护式。过滤膜的形式有圆筒状和平板状两种。过滤膜大多为亚高效或高效过滤材料制成。

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